GeoNature : guide complet pour les collectivités et la communauté francophone
Les collectivités territoriales, parcs naturels et observatoires de la biodiversité disposent aujourd’hui d’un volume croissant de données naturalistes… mais peinent souvent à les structurer, les partager et les valoriser. GeoNature s’impose progressivement comme le socle open source de référence pour répondre à ces enjeux, au cœur de l’écosystème français de la gestion de la biodiversité.
Dans ce guide complet, vous allez découvrir comment mettre en place GeoNature, vous appuyer sur la communauté francophone, migrer vos bases existantes, choisir une solution d’hébergement et bâtir un véritable projet de gouvernance des données naturalistes. Des prestataires spécialisés comme Natural Solutions peuvent vous accompagner à chaque étape, de l’audit initial jusqu’à l’hébergement clé en main.
Comprendre GeoNature : un socle open source pour les données naturalistes
GeoNature est une plate-forme open source de gestion des données naturalistes née des besoins du Parc national des Écrins et progressivement consolidée avec l’appui de l’Office français de la biodiversité (OFB) et d’une large communauté d’utilisateurs. Son objectif : offrir un socle robuste, partagé et interopérable pour centraliser, qualifier et diffuser les observations de faune, flore, habitats et autres données environnementales.
GeoNature s’articule autour de plusieurs modules complémentaires :
Modules de saisie : formulaires adaptés aux inventaires ponctuels, suivis standardisés, protocoles spécifiques, saisie par lot, etc.
Modules de validation : workflow de validation scientifique, gestion des rôles, traçabilité des décisions, historisation des modifications.
Modules de consultation : recherche multicritère, cartographie, filtres temporels, exports, tableaux de bord.
L’outil s’adresse à un large éventail d’acteurs :
Collectivités territoriales (communes, intercommunalités, départements, régions) souhaitant structurer un observatoire de la biodiversité ou alimenter leurs politiques publiques.
Parcs naturels nationaux et régionaux, réserves naturelles, conservatoires d’espaces naturels.
Associations naturalistes et groupes d’experts thématiques (ornithologie, herpétologie, botanique…).
Observatoires de la biodiversité, plateformes régionales de données, cellules SIG et services environnement.
Bureaux d’études souhaitant mutualiser et sécuriser leurs données d’expertises.
Les bénéfices pour ces structures sont multiples :
Centralisation de l’ensemble des observations dans une base structurée et pérenne.
Standardisation des champs et des protocoles, facilitant l’analyse et le partage.
Interopérabilité avec les outils nationaux : SINP, TaxRef, standards de données, export vers d’autres systèmes.
Intégration dans un écosystème complet : GeoNature portail pour la gestion des applications, GeoNature atlas pour la diffusion cartographique publique, GeoNature mobile pour la collecte de données sur le terrain.
En résumé, GeoNature constitue aujourd’hui une véritable infrastructure métier pour les données naturalistes, capable de s’intégrer aux systèmes d’information géographique (SIG) existants et de répondre aux exigences réglementaires et scientifiques des acteurs publics et privés.
S’appuyer sur la communauté francophone GeoNature et les offres de support
L’un des points forts de GeoNature réside dans sa communauté francophone, très active et structurée. Elle rassemble des agents de collectivités, gestionnaires d’espaces naturels, développeurs, administrateurs système et naturalistes, qui partagent leurs pratiques et contribuent à l’amélioration continue de la solution.
La communauté s’organise autour de plusieurs espaces d’échange :
Listes de diffusion et groupes de discussion pour les annonces, questions générales et retours d’expérience.
Slack ou forum communautaire pour un support plus réactif, des échanges techniques et des groupes thématiques.
GitHub pour le suivi du code source, la gestion des anomalies (issues), la soumission de correctifs et d’améliorations.
Wiki et documentation en ligne pour les guides d’installation, de paramétrage et d’administration.
Journées utilisateurs et ateliers techniques, favorisant le partage de bonnes pratiques et la co-construction.
Pour obtenir du support via la communauté, vous pouvez :
Poser vos questions fonctionnelles ou techniques sur les canaux dédiés.
Consulter et enrichir la documentation, partager vos scripts ou modèles d’exports.
Capitaliser sur les retours d’expérience d’autres collectivités ayant des problématiques similaires.
En complément, il existe en France des prestataires spécialisés proposant du support professionnel GeoNature : installation, paramétrage, développements spécifiques, contrats de maintenance, assistance à l’exploitation, formations. Des sociétés comme Natural Solutions peuvent assurer :
L’hébergement et l’exploitation de la plateforme.
Le support technique et fonctionnel, avec engagements de service.
L’accompagnement à la gouvernance des données et aux interconnexions avec vos autres outils.
Pour collaborer efficacement avec la communauté, quelques bonnes pratiques s’imposent :
Remonter les bugs de façon précise (version, contexte, étapes pour reproduire, journaux d’erreurs).
Proposer des évolutions en détaillant les besoins métier et les cas d’usage.
Contribuer à la documentation, aux tests ou à la traduction si vous ne développez pas.
Respecter les codes de conduite, garder un ton constructif et partager en retour vos solutions.
Cette dynamique communautaire, complétée par l’appui de prestataires comme Natural Solutions, permet de sécuriser vos projets GeoNature sur le long terme.
Formation GeoNature pour les collectivités territoriales et structures publiques
Pour une collectivité ou une structure publique, la mise en place de GeoNature ne se limite pas à une installation technique. Le succès du projet repose sur la montée en compétence des équipes : agents SIG, chargés d’études, naturalistes, administrateurs système, validateurs, etc.
Les besoins spécifiques des collectivités territoriales sont souvent les suivants :
Gestion des inventaires naturalistes issus d’études internes ou de prestataires.
Suivi des espèces patrimoniales, invasives, protégées, ou faisant l’objet de plans d’action.
Réponse aux obligations réglementaires (rapports environnementaux, enquêtes publiques, dossiers de planification, SRCE, SRADDET, etc.).
Production de cartes et d’indicateurs pour les élus, services internes et partenaires.
On distingue plusieurs types de formations GeoNature :
Prise en main fonctionnelle : découverte de l’interface, saisie d’observations, consultation, exports.
Administration technique : installation, mises à jour, sauvegardes, supervision.
Paramétrage avancé : configuration des modules, profils d’utilisateurs, référentiels, formulaires.
Formation des validateurs : gestion du processus de validation, contrôle qualité des données.
Formation des agents de terrain, notamment avec GeoNature mobile, pour la collecte sur le terrain.
Un parcours de formation type pour une collectivité pourrait être :
Phase découverte (1 à 2 jours) : présentation des concepts, démonstration, premiers cas pratiques.
Phase projet (2 à 3 jours) : paramétrage adapté au contexte local, structuration des référentiels et des protocoles.
Phase production (1 à 2 jours) : formation des utilisateurs finaux, des validateurs et du support interne.
Phase consolidation : ateliers de retour d’expérience, ajustements, optimisation des flux de données.
Des modules spécifiques peuvent être développés pour :
Les observatoires de la biodiversité : gestion des jeux de données, indicateurs, publications.
Les équipes SIG : interfaçage avec les bases géographiques, production cartographique avancée.
Des prestataires spécialisés peuvent proposer des parcours modulaires et sur mesure. En complément de GeoNature, des produits métiers comme ceux présentés dans la gamme produits Natural Solutions peuvent venir enrichir votre dispositif (applications de terrain, portails cartographiques, etc.), avec des formations dédiées.
Comment migrer une base de données naturalistes existante vers GeoNature
De nombreuses structures disposent déjà de bases de données naturalistes dans des formats variés : tableurs, bases Access, PostgreSQL, fichiers SIG, applications maison. La migration vers GeoNature est une étape clé pour homogénéiser, sécuriser et valoriser ces historiques d’observations.
Avant de lancer la migration, plusieurs prérequis sont indispensables :
Audit de la base existante : inventaire des tables, des champs, des contraintes, des volumes de données.
Analyse des formats : structure des fichiers, systèmes de coordonnées, conventions utilisées (codes espèces, types de données).
Évaluation de la qualité : doublons, données incomplètes, incohérences, absence de métadonnées.
Harmonisation des nomenclatures : taxonomie, types d’habitats, méthodes d’observation, unités.
Une méthodologie de migration pas à pas peut être la suivante :
Définir le mapping des champs entre la base source et le schéma de GeoNature (observations, taxons, métadonnées).
Gérer les référentiels taxonomiques en rapprochant vos listes d’espèces de TaxRef ou d’un référentiel reconnu.
Traiter l’historisation : conserver les dates de création, de mise à jour, les auteurs, les statuts de validation.
Élaborer des scripts de transformation (ETL, scripts SQL) pour nettoyer, enrichir et restructurer les données.
Charger les données dans un environnement de test via les API de GeoNature ou des scripts de chargement spécifiques.
Contrôler la qualité par des tests fonctionnels (recherche, cartographie) et par des validations métier avec les naturalistes.
Plusieurs outils peuvent être mobilisés : outils ETL, scripts PostgreSQL, API de GeoNature pour la création d’observations, voire des outils complémentaires issus de la communauté. Il est recommandé de :
Travailler dans un environnement de préproduction distinct de la future production.
Mettre en place des sauvegardes complètes de la base source avant toute opération.
Prévoir un plan de reprise en cas de problème lors de la bascule finale.
Associer étroitement les référents métier pour valider les résultats (volumes, distribution des données, cohérence).
La migration est aussi l’occasion d’optimiser vos processus et de revoir votre gouvernance des données. Un accompagnement par un expert GeoNature ou un prestataire comme Natural Solutions permet de sécuriser cette étape, notamment pour des volumes importants ou des bases très hétérogènes.
Exemples de projets GeoNature réussis en France et retours d’expérience
Partout en France, des structures de tailles et de profils variés ont déjà mis en production GeoNature avec succès. Ces retours d’expérience montrent que l’outil s’adapte aussi bien à un petit observatoire local qu’à une métropole ou à un réseau de partenaires.
Parmi les exemples typiques de projets réussis, on trouve :
Des parcs naturels régionaux qui centralisent les observations issues de leurs agents, des associations partenaires et des bureaux d’études.
Des départements qui structurent un observatoire de la biodiversité à l’échelle de leur territoire, en lien avec les politiques environnementales.
Des métropoles et intercommunalités qui utilisent GeoNature pour alimenter leurs plans climat, trames vertes et bleues, projets d’aménagement.
Des conservatoires d’espaces naturels qui suivent l’évolution d’habitats, d’espèces patrimoniales et d’actions de gestion.
Les résultats obtenus sont généralement convergents :
Amélioration du partage de l’information entre services internes et partenaires.
Consolidation des données historiquement dispersées dans des tableurs, fichiers SIG ou bases isolées.
Aide accrue à la décision pour les élus et les techniciens grâce à des cartes, indicateurs et rapports fiables.
Gain de temps sur la production de bilans, de rapports réglementaires et de réponses aux sollicitations externes.
Plusieurs facteurs clés de succès se dégagent :
Une gouvernance des données claire (qui saisit, qui valide, qui consulte, selon quelles règles).
L’implication des partenaires dès la phase de cadrage (collectivités voisines, associations, services de l’État).
Un support technique solide, assuré par la communauté et/ou par un prestataire professionnel.
Un investissement dans la formation et l’accompagnement au changement auprès des équipes.
Pour les observatoires de la biodiversité, les cas d’usage sont nombreux :
Suivi d’espèces protégées, exotiques envahissantes ou d’intérêt local, avec production de cartes d’alerte.
Cartographie thématique pour les documents de planification, les études d’impact, les diagnostics écologiques.
Reporting réglementaire (bilans, tableaux de bord, indicateurs de suivi de plans d’actions).
Dans plusieurs de ces projets, l’appui de sociétés expertes en biodiversité numérique et en outils open source, comme Natural Solutions, a été déterminant pour structurer la démarche, assurer l’intégration avec d’autres solutions métiers et garantir une exploitation durable.
Solutions d’hébergement GeoNature clé en main et bonnes pratiques d’exploitation
La question de l’hébergement GeoNature est stratégique : elle conditionne la performance, la disponibilité, la sécurité et la facilité de maintenance de votre solution. Plusieurs options sont possibles, chacune avec ses avantages et contraintes.
Les principales options d’hébergement sont :
Serveurs internes (infrastructure de la collectivité ou de l’organisme) : maîtrise complète, mais nécessite des compétences système et une capacité de maintenance.
Hébergement dans le cloud (infrastructures externalisées) : flexibilité, redimensionnement plus facile, mais nécessite une bonne maîtrise des aspects techniques et contractuels.
Hébergement via un prestataire spécialisé : solution de type clé en main où l’installation, les mises à jour, la surveillance et les sauvegardes sont gérées pour vous.
Un hébergement GeoNature « clé en main » inclut généralement :
L’installation initiale et la configuration de GeoNature et de ses composants.
La gestion des mises à jour correctives et évolutives.
La mise en place de sauvegardes automatisées et de tests de restauration.
La supervision de la disponibilité et des performances.
Un support technique accessible, avec des engagements de qualité de service.
Pour dimensionner et sécuriser votre plateforme, il est conseillé de :
Évaluer les volumes de données et le nombre d’utilisateurs simultanés.
Prévoir des ressources suffisantes (CPU, mémoire, stockage) pour absorber les pics d’activité.
Renforcer la sécurité (certificats, pare-feu, gestion des droits, mises à jour système régulières).
Mettre en place une haute disponibilité et un plan de reprise d’activité pour les contextes critiques.
Une check-list d’exploitation quotidienne pour les administrateurs système et SIG peut inclure :
Vérification de la disponibilité de la plateforme et des principaux services.
Contrôle des journaux d’erreurs et des alertes de supervision.
Suivi de l’espace disque et des performances (temps de réponse, charge serveur).
Vérification régulière des sauvegardes et tests périodiques de restauration.
Mise à jour planifiée des composants, en concertation avec les utilisateurs.
Recourir à un hébergement clé en main proposé par un prestataire expert en solutions pour la biodiversité, tel que Natural Solutions, permet de se concentrer sur le cœur de métier (gestion des données, analyses, décisions) tout en garantissant une exploitation fiable. Leurs produits Natural Solutions peuvent d’ailleurs être intégrés à votre architecture pour compléter GeoNature (applications mobiles, portails, tableaux de bord).
Conclusion et plan d’action pour lancer ou renforcer votre projet GeoNature
Déployer GeoNature, ce n’est pas seulement installer un logiciel : c’est structurer une véritable stratégie de gestion des données naturalistes. Pour réussir, il est essentiel de suivre quelques étapes clés :
Cadrage : définir vos objectifs (observatoire, suivi d’espèces, obligations réglementaires), vos partenaires, vos jeux de données.
Choix d’hébergement : interne, cloud ou clé en main avec un prestataire spécialisé.
Migration de vos bases existantes en appliquant une méthodologie rigoureuse et en sécurisant la qualité des données.
Formation des équipes (administrateurs, naturalistes, agents de terrain, validateurs).
Support et gouvernance : s’appuyer sur la communauté francophone, définir les rôles et responsabilités autour des données.
Pour passer à l’action, vous pouvez vous appuyer sur un plan 30/60/90 jours :
30 jours : cadrer le projet, identifier les référents internes, réaliser un diagnostic de l’existant (bases de données, usages).
60 jours : choisir le mode d’hébergement, installer une instance de test, débuter la migration pilote et la formation des premiers utilisateurs.
90 jours : finaliser la migration, passer en production, formaliser la gouvernance des données, organiser les premiers retours d’expérience.
Tout au long de ce parcours, l’appui de la communauté GeoNature francophone et de prestataires spécialisés est un levier majeur pour sécuriser votre démarche. En combinant l’expertise métier, l’expérience technique et la dynamique communautaire, vous disposez de tous les atouts pour faire de GeoNature le pilier de votre système d’information biodiversité.
Prêt à structurer et valoriser vos données naturalistes avec GeoNature ? Contactez un expert et rejoignez la communauté francophone pour bénéficier d’un accompagnement, d’une formation adaptée et d’une solution d’hébergement clé en main. Pour aller plus loin, découvrez les services et solutions de Natural Solutions et explorez leurs produits Natural Solutions complémentaires à votre future plateforme GeoNature.
FAQ GeoNature pour les collectivités et observatoires de la biodiversité
Qu’est-ce que GeoNature et à quoi sert-il pour une collectivité territoriale ?
GeoNature est une plateforme open source dédiée à la gestion des données naturalistes (faune, flore, habitats, etc.). Pour une collectivité territoriale, il sert à :
Centraliser toutes les observations issues des études, des partenaires et des services internes.
Structurer et standardiser les données pour faciliter l’analyse, la cartographie et le partage.
Alimenter les politiques publiques (urbanisme, biodiversité, trame verte et bleue) avec des informations fiables.
Répondre plus facilement aux obligations réglementaires de suivi et de reporting.
Comment obtenir du support GeoNature via la communauté francophone et des prestataires en France ?
Pour obtenir du support, vous pouvez :
Rejoindre la communauté francophone (listes de diffusion, Slack ou forum, GitHub) et poser vos questions.
Consulter la documentation en ligne, les wikis et retours d’expérience des autres utilisateurs.
Vous appuyer sur des prestataires spécialisés en France, comme Natural Solutions, qui proposent installation, maintenance, hébergement et accompagnement sur mesure.
Comment migrer une base de données naturalistes existante vers GeoNature sans perte de données ?
Pour migrer sans perte de données, il est recommandé de :
Réaliser un audit complet de la base existante (structure, formats, qualité).
Définir un mapping précis entre les champs source et ceux de GeoNature, y compris pour la taxonomie et les métadonnées.
Utiliser des scripts de transformation (ETL, SQL) et les API GeoNature dans un environnement de test.
Mettre en place des sauvegardes et un plan de reprise avant la bascule finale.
Faire valider les résultats par les référents métier et naturalistes.
Un accompagnement par un expert GeoNature ou un prestataire comme Natural Solutions facilite grandement cette étape, surtout pour des bases volumineuses ou complexes.
Quelles sont les meilleures pratiques GeoNature pour un observatoire de la biodiversité ?
Pour un observatoire de la biodiversité, les bonnes pratiques incluent :
Définir une gouvernance des données (rôles, responsabilités, règles de saisie et de validation).
Standardiser les référentiels (taxonomie, habitats, méthodes) en lien avec les standards nationaux.
Mettre en place un workflow de validation pour garantir la qualité des observations.
Organiser la formation des contributeurs (saisie, validation, exploitation des données).
Documenter les jeux de données et les protocoles pour assurer la traçabilité scientifique.
Quelles solutions d’hébergement GeoNature clé en main existent en France et comment choisir ?
En France, plusieurs prestataires proposent des solutions d’hébergement GeoNature clé en main : installation, maintenance, mises à jour, sauvegardes et support. Pour choisir, il est conseillé de :
Vérifier l’expérience du prestataire sur GeoNature et les projets biodiversité.
Comparer les niveaux de service (disponibilité, support, supervision, sécurité).
Évaluer les options de dimensionnement et d’évolution en fonction de vos besoins.
Analyser les coûts globaux (hébergement, maintenance, support, éventuels développements spécifiques).
Des acteurs comme Natural Solutions proposent des offres complètes, intégrant GeoNature et des outils complémentaires, adaptées aux collectivités, parcs naturels et observatoires de la biodiversité.